施工许可证领取后迟迟没有开工，双方在施工合同里约定继续等两年，不等于行政许可也随之永久有效。建筑法第九条规定了开工、延期及自行废止的条件，合同安排与许可状态应同步核查，不能只保留一张旧证便认为以后任何时间都可直接施工。
开工期限与延期有明确限制
依法领取施工许可证后，建设单位应在三个月内开工；因故不能按期开工，向发证机关申请延期。延期以两次为限，每次不超过三个月。既不开工又不申请，或超过延期时限的，施工许可证自行废止。次数和期限不是由发包人与承包人私下另行约定即可修改。
应查领证日期、是否真实开工、申请及批准延期的记录。只向监理或施工企业发通知，与依法向发证机关申请不同；口头说主管人员知道项目延迟，也不等于已经完成适用手续。
是否已经开工必须依据实际状态
现场围挡、进场准备和正式施工在具体管理上可能有区别，不能为保留许可效力倒填开工记录，也不宜仅凭项目照片推定已经满足所有要求。存在争议，应按项目真实情况向有权机关核实，不拿网络文章替代具体监管认定。
如果项目已经开工后中止，又涉及建筑法第十条的报告、维护管理和恢复要求；中止满一年恢复前还需核验施工许可证。开工前延期和开工后中止，适用条件不同，不能相互挪用次数来延长。
许可有效不等于其他条件都齐全
规划、用地、质量安全、资质及实际施工条件，应按各自规则核查。领取施工许可本身不能豁免后来出现的危险或其他违法问题；许可自行废止，也不能反过来宣布过去所有合同和已完成成果均不存在。
对重新办理或补办手续的具体要求，以有权机关和现行规定为准，不应自行推定缴纳一笔费用便可立即复工。施工企业知悉许可问题后仍违章施工，不能仅用合同要求赶工免除自身相应义务。
合同工期和停等损失另行核对
延期起因、谁负责申请、双方何时知悉，以及是否依法可以继续施工，可能影响工期和损失分析。许可延期获准，不当然使承包人合同工期同步免费延长；双方约定了工期调整，也不当然使许可恢复有效。
保留通知、审批、现场和费用材料，对必要保护、人员设备停等及减损措施分别说明。不能只凭项目延误就把全部预计利润列为确定损失。
复工前形成真实状态清单
把许可证当前效力、应办手续、现场安全、合同开工条件和各方责任列在同一张表中，经合法核实后再安排施工。避免许可与合同各自沿用不同日期，既保障依法开工，也让后续工期和费用争议有可以查证的基础。