组织已经成立之后才接手其日常运行，不能仅凭自己不是最初发起人，便排除组织、领导恐怖组织罪。二〇一八年四部门意见第一部分第一项，将组织成立后，对组织及其日常运行负责决策、指挥、管理，单独列为组织、领导的认定情形，不限于最初建立或者具体指挥某一次活动。
先证明所指确为法定恐怖活动组织
反恐怖主义法第三条对恐怖活动组织有法定界定，要求三人以上为实施恐怖活动而组成的犯罪组织。人数、组成目的及具体事实需要依法核明，不能把普通工作群、宗教团体、一般海外往来或某个共同联系人直接贴上这一标签。
对法定组织性质的证明与个人作用的证明，应相互连接但不能互相取代。某人具有管理权限，不自动使正常机构变成该组织；组织性质已成立，也不自动使每一名普通成员均成为领导者。
成立后的日常运行与一般事务劳动分开
意见并列发起建立、成立后负责日常决策指挥管理、组织策划指挥成员进行恐怖活动等情形。适用日常运行这一项时，应查真实决定权、管理内容及对组织运行的作用，而不是只问是否曾在具体行动现场。
只执行某项普通事务、被挂上一个称谓，与真正对日常运行负责，不能按职位名称直接等同。反过来，已经有实际负责的证据，也不能只用没有最初发起或者没有亲自实施某次袭击，替代对这一独立列举情形的审查。
本罪角色与别罪的共同犯罪评价不能互抄
刑法第一百二十条区分组织领导、积极参加和其他参加。普通共同犯罪中谁是主犯、是否现场实施，不能未经对应便包办这里的法定角色。若另指具体犯罪，仍须依法查该行为及本人责任，不能让组织角色自动吸收全部他人行为。
可将组织性质依据、成立时间、本人介入期间、真实决策管理事项及证据分栏核对，准确标注转述和待查部分。不为说明权限重入或联络危险组织，不补造普通雇佣关系，也不公开相关危险内容。法律分析应回答具体落入哪一列举情形，而不是以敏感称谓或者未发起一句话预定结果。
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