收到征求意见书，应先确定拟公开的具体内容
企业向行政机关提交过技术说明、成本资料或交易合同，后来收到因他人信息公开申请而发出的征求意见书，应先核文号、收到日期、拟公开范围与回复方式。文件原本来自企业，不代表交给行政机关后绝对不能公开；同样，机关已经保存，也不等于可以不审查商业秘密便全文提供。
政府信息公开条例第二条将行政管理中制作或获取、记录保存的信息纳入相应范围。第十五、三十二条保护的是公开会损害第三方合法权益的商业秘密等信息，并同时设置第三方同意和重大公共利益等例外。因此，需要作出有证据的具体意见，不能只在来函上盖一个不同意章。
十五个工作日内提交逐项理由，不把沉默当成否决
第三十二条规定，第三方应自收到征求意见书之日起十五个工作日内提出意见。应保存完整送达材料和提交回执，建立负责人、技术、法务之间的处理安排，不因内部正在审批就放任期限。
逾期未提出意见，由行政机关依条例决定是否公开，不是自动同意，也不是自动不公开。第三方不同意且有合理理由的，机关不予公开；但主张理由是否成立仍需依法审查。补充材料是否被收到、实际供审查的是哪个版本，也应有记录。
说明秘密在哪里、怎样保护以及公开会造成什么损害
可以按页码或字段标明拟保护的配方、工艺参数、未公开成本结构或特定经营安排，并对应权利归属、接触范围、保密协议、访问权限和实际保密管理记录。说明哪些内容已经公开、哪些只是一般行业知识，避免把法定应公开的事项或网上早已发布的数据一并包装成秘密。
损害说明也要落到具体内容。例如竞争者能够从哪些参数反推出未公开方案、取得何种交易优势，依据何在。不是要求企业自行公布全部秘密来证明秘密，而是向有权处理机关以适当方式提供足以核验的理由和证据，并明确提交材料本身的保密请求。
涉及客户或合作方的秘密，应核谁有权作出同意、是否还需征求其他第三方意见。本企业在回复中同意某部分公开，不宜擅自替其他权利人作出全面授权。
允许区分处理，但不能凭保密标注取消公共利益审查
条例第三十七条要求对能够区分的内容提供可公开部分，并说明不公开部分的理由。企业可以提交原件与标示版、建议遮盖范围和公开版本，帮助机关逐项判断，而不是坚持只要一行含秘密就整个文件永久封存。
行政机关认为不公开可能对公共利益造成重大影响，可以决定公开，并应将公开内容和理由书面告知第三方。企业应核实际公共利益理由及拟披露范围，针对争点回应；不能把任何不利商誉、经营压力都等同于法定商业秘密，也不能把商业秘密保护说成当然排除安全、环境等依法应有的公众监督。
必要时在公开之前评估预防救济
自二〇二五年六月起施行的最高法政府信息公开司法解释，明确第三方因公开行为侵害商业秘密等权益的诉讼与举证规则。第七条要求请求不得公开者对涉及自己的秘密及权益损害举证；第十三条规定信息尚未公开时依法请求判令不得公开，以及诉讼中申请暂时停止公开的条件。
这与申请人不服不予公开的复议前置情形并不相同，应按自己的第三方身份、机关行为和阶段选择程序，不把一封反对函当成法院已作停止公开裁定。已经知悉拟公开决定且可能发生难以弥补损害的，应及时评估，不等网页上线后再寻找原证据。
委托材料宜包括原提交文件、征求意见书与送达记录、秘密逐项清单、保密措施和损害证据、可区分公开方案及机关决定。律师可帮助确定保护范围与具体请求，不能保证所有标注保密的材料都能禁止公开，也不以投诉正在办理承诺公开行为当然停止。